yl6809永利官网由原医学院药理学系和药学系组建而成，药理学系的前身源于1938年国立江苏医学院药理学教研组，1952年开始培养临床医学本科生，1984年开始培养硕士研究生，2005年获批招收药学专业本科生，2010年获批成为药学一级学科硕士学位授权点。

学院设有5个系和1个药学实验中心，分别是基础药理系、临床药理系、药物化学系、药物制剂系和天然药物系。药学实验中心下设本科教学实验室、江苏省炎症与分子药靶重点实验室、南通市生物医药研究重点实验室、yl6809永利官网药物研究所等教学与科研实验基地。

yl6809永利官网现有药学和药物制剂学2个本科专业。药学学科为yl6809永利官网博士学位授权培育学科和江苏省重点培育学科；药学学科为我院一级硕士学位授权学科（涵盖临床药学、药理学、药剂学、药物化学、药物分析、微生物与生物技术药学、生药学及社会与管理药学8个二级学科）。